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公告内容

- 1 -入 札 公 告次 の と お り 一 般 競 争 入 札 に 付 し ま す 。

令 和 ５ 年 ６ 月 １ ２ 日国 立 研 究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構水 産 資 源 研 究 所 管 理 部 門 長 小 林 正 裕１ ． 調 達 内 容( １ ) 調 達 件 名 及 び 数 量 ( 単 価 契 約 ) 東 シ ナ 海 及 び 日 本 海 に お け る 浮 魚 類 の 環 境 D N A 分析 業 務 一 式( ２ ) 調 達 仕 様 入 札 説 明 書 に よ る 。

( ３ ) 履 行 期 限 令 和 ６ 年 ２ 月 ２ ２ 日( ４ ) 納 入 場 所 入 札 説 明 書 に よ る 。

( ５ ) 入 札 方 法 入 札 金 額 は 、 契 約 希 望 単 価 に 予 定 検 体 数 を 乗 じ て 算 出 し た金 額 を 記 載 す る こ と 。ま た 、 落 札 決 定 に 当 た っ て は 、 入 札 書に 記 載 さ れ た 金 額 に 当 該 金 額 の １ ０ ０ 分 の １ ０ に 相 当 す る 額を 加 算 し た 金 額 ( 当 該 金 額 に １ 円 未 満 の 端 数 が あ る と き は 、そ の 端 数 金 額 を 切 り 捨 て た 金 額 ) を も っ て 落 札 価 格 と す る ので 、 入 札 者 は 、 消 費 税 及 び 地 方 消 費 税 に 係 る 課 税 事 業 者 で ある か 免 税 事 業 者 で あ る か を 問 わ ず 、 見 積 も っ た 契 約 希 望 金 額の １ １ ０ 分 の １ ０ ０ に 相 当 す る 金 額 を 入 札 書 に 記 載 す る こ と 。

２ ． 競 争 参 加 資 格( １ ) 国 立 研 究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構 契 約 事 務 取 扱 規 程 ( 平 成 １ ３ 年 ４ 月 １ 日 付 け １ ３水 研 第 ６ ５ 号 ) 第 １ ２ 条 第 １ 項 及 び 第 １ ３ 条 の 規 定 に 該 当 し な い 者 で あ る こ と 。

( ２ ) 令 和 ４ ・ ５ ・ ６ 年 度 国 立 研 究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構 競 争 参 加 資 格 又 は 全 省 庁 統 一資 格 の ｢ 役 務 の 提 供 等 契 約 ｣ の 業 種 「 調 査 ・ 研 究 」 又 は 「 そ の 他 」 で 「 Ａ 」 、 「 Ｂ 」 、「 Ｃ 」 又 は 「 Ｄ 」 い ず れ か の 等 級 に 格 付 け さ れ て い る 者 で あ る こ と 。

( ３ ) 国 立 研 究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構 理 事 長 か ら 物 品 の 製 造 契 約 、 物 品 の 販 売 契 約 及 び役 務 等 契 約 指 名 停 止 措 置 要 領 に 基 づ く 指 名 停 止 を 受 け て い る 期 間 中 で な い こ と 。

た だ し 、 全 省 庁 統 一 資 格 に 格 付 け さ れ て い る 者 で あ る 場 合 は 、 国 の 機 関 の 同 様 の 指 名 停止 措 置 要 領 に 基 づ く 指 名 停 止 を 受 け て い る 期 間 中 で な い こ と 。

( ４ ) 暴 力 団 員 に よ る 不 当 な 行 為 の 防 止 等 に 関 す る 法 律 ( 平 成 ３ 年 法 律 第 ７ ７ 号 ) 第 ３ ２ 条 第１ 項 各 号 に 掲 げ る 者 で な い こ と 。

３ ． 入 札 説 明 書 等 の 交 付 方 法 競 争 参 加 希 望 者 は 、 以 下 に よ り 入 札 説 明 書 等 ( 入 札 説 明書 、 入 札 心 得 書 、 契 約 書 案 、 入 札 書 様 式 、 委 任 状 様 式 等 )の 交 付 を 受 け る こ と 。

① 直 接 交 付長 崎 県 長 崎 市 多 以 良 町 １ ５ ５ １ － ８国 立 研 究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構 水 産 資 源 研 究 所管 理 部 門 管 理 課電 話 ０ ９ ５ － ８ ６ ０ － １ ６ ２ ６Ｆ Ａ Ｘ ０ ９ ５ － ８ ５ ０ － ７ ７ ６ ７② 郵 送 に よ る 交 付封 書 に 「 ( 単 価 契 約 ) 東 シ ナ 海 及 び 日 本 海 に お け る 浮 魚類 の 環 境 D N A分 析 業 務 入 札 説 明 書 希 望 」 と 記 入 し 、 返信 用 封 筒 ( 角 ２ ) に ２ ５ ０ 円 切 手 を 貼 付 し 、 上 記 ① あて 郵 送 の こ と 。

③ メ ー ル に よ る 交 付任 意 書 式 に 「 ( 単 価 契 約 ) 東 シ ナ 海 及 び 日 本 海 に お け る浮 魚 類 の 環 境 D N A 分 析 業 務 入 札 説 明 書 メ ー ル に て 希望 」 と 記 入 し 、 社 名 、 担 当 者 名 、 メ ー ル ア ド レ ス 、 電話 番 号 を 記 載 の う え 、 上 記 ① あ て Ｆ Ａ Ｘ 送 信 す る こ と 。

４ ． 入 札 説 明 会 の 日 時 及 び 場 所 等 仕 様 書 等 に 関 し 質 疑 が あ る 場 合 に は 、 令 和 ５ 年 ６ 月 ２ ２日 ま で に 上 記 ３ ． あ て に メ ー ル ( ア ド レ ス は 入 札 説 明 書に 記 載 ) 又 は フ ァ ッ ク ス に て 質 疑 を 行 う こ と 。当 日 ま での 質 疑 を 取 り ま と め 、 回 答 は 入 札 説 明 書 受 領 者 全 員 に 対- 2 -し て 行 う と と も に 当 機 構 の ホ ー ム ペ ー ジ に て 公 表 す る こ とに よ り 入 札 説 明 会 に 代 え る 。

な お 、 当 該 日 以 降 に 質 疑 が 発 生 し た 場 合 も 随 時 受 け 付 け 、同 様 に 対 応 す る 。

た だ し 、 質 疑 内 容 に 個 人 に 関 す る 情 報 で あ っ て 特 定 の 個人 を 識 別 し 得 る 記 述 が あ る 場 合 及 び 法 人 等 の 財 産 権 等 を 侵害 す る お そ れ の あ る 記 述 が あ る 場 合 に は 、 当 該 箇 所 を 伏 せ又 は 当 該 質 疑 を 公 表 せ ず 、 質 疑 者 の み に 回 答 す る こ と が ある 。

５ ． 入 札 の 日 時 及 び 場 所 等( １ ) 入 札 の 日 時 及 び 場 所 令 和 ５ 年 ６ 月 ２ ８ 日 １ ４ 時 ０ ０ 分長 崎 県 長 崎 市 多 以 良 町 １ ５ ５ １ － ８国 立 研 究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構水 産 資 源 研 究 所 小 会 議 室( ２ ) 郵 便 に よ る 入 札 書 の 令 和 ５ 年 ６ 月 ２ ８ 日 １ ２ 時 ０ ０ 分受 領 期 限 及 び 提 出 場 所 ３ ． ① に 同 じ 。

６ ． そ の 他( １ ) 契 約 手 続 き に お い て使 用 す る 言 語 及 び 通 貨 日 本 語 及 び 日 本 国 通 貨 。

( ２ ) 入 札 保 証 金 及 び 契 約 保 証 金 免 除 。

( ３ ) 入 札 の 無 効 本 公 告 に 示 し た 競 争 参 加 資 格 の な い 者 の 提 出 し た 入 札 書及 び 入 札 に 関 す る 条 件 に 違 反 し た 入 札 書 は 無 効 と す る 。

( ４ ) 契 約 書 作 成 の 要 否 要 。

( ５ ) 落 札 者 の 決 定 方 法 予 定 価 格 の 制 限 の 範 囲 内 で 最 低 価 格 を も っ て 有 効 な 入 札を 行 っ た 入 札 者 を 落 札 者 と す る 。

( ６ ) 競 争 参 加 者 は 、 入 札 の 際 に 国 立 研 究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構 の 資 格 審 査 結 果 通 知 書写 し 又 は 全 省 庁 統 一 資 格 の 資 格 審 査 結 果 通 知 書 写 し を 提 出 す る こ と 。

( ７ ) 詳 細 は 入 札 説 明 書 に よ る 。

７ ． 契 約 に 係 る 情 報 の 公 表( １ ) 公 表 の 対 象 と な る 契 約 先次 の ① 及 び ② い ず れ に も 該 当 す る 契 約 先① 当 機 構 に お い て 役 員 を 経 験 し た 者 ( 役 員 経 験 者 ) が 再 就 職 し て い る こ と 又 は 課 長 相当 職 以 上 の 職 を 経 験 し た 者 ( 課 長 相 当 職 以 上 経 験 者 ) が 役 員 、 顧 問 等 ※ 注 １ と し て再 就 職 し て い る こ と② 当 機 構 と の 間 の 取 引 高 が 、 総 売 上 高 又 は 事 業 収 入 の ３ 分 の １ 以 上 を 占 め て い る こ と※ 注 ２な お 、 「 当 機 構 」 と は 、 改 称 前 の 独 立 行 政 法 人 水 産 総 合 研 究 セ ン タ ー 及 び 国 立 研 究 開 発法 人 水 産 総 合 研 究 セ ン タ ー 、 統 合 前 の 独 立 行 政 法 人 水 産 大 学 校 を 含 み ま す 。

※ 注 １ 「 役 員 、 顧 問 等 」 に は 、 役 員 、 顧 問 の ほ か 、 相 談 役 そ の 他 い か な る 名 称 を 有 す る者 で あ る か を 問 わ ず 、 経 営 や 業 務 運 営 に つ い て 、 助 言 す る こ と 等 に よ り 影 響 力 を 与え る と 認 め ら れ る 者 を 含 む 。

※ 注 ２ 総 売 上 高 又 は 事 業 収 入 の 額 は 、 当 該 契 約 の 締 結 日 に お け る 直 近 の 財 務 諸 表 に 掲 げら れ た 額 に よ る こ と と し 、 取 引 高 は 当 該 財 務 諸 表 の 対 象 事 業 年 度 に お け る 取 引 の 実績 に よ る 。

( ２ ) 公 表 す る 情 報上 記 ( １ ) に 該 当 す る 契 約 先 に つ い て 、 契 約 ご と に 、 物 品 役 務 等 の 名 称 及 び 数 量 、 契 約締 結 日 、 契 約 先 の 名 称 、 契 約 金 額 等 と 併 せ 、 次 に 掲 げ る 情 報 を 公 表 す る 。

① 当 機 構 の 役 員 経 験 者 及 び 課 長 相 当 職 以 上 経 験 者 ( 当 機 構 Ｏ Ｂ ) の 人 数 、 職 名 及 び 当機 構 に お け る 最 終 職 名② 当 機 構 と の 間 の 取 引 高③ 総 売 上 高 又 は 事 業 収 入 に 占 め る 当 機 構 と の 間 の 取 引 高 の 割 合 が 、 次 の 区 分 の い ず れか に 該 当 す る 旨３ 分 の １ 以 上 ２ 分 の １ 未 満 、 ２ 分 の １ 以 上 ３ 分 の ２ 未 満 又 は ３ 分 の ２ 以 上④ 一 者 応 札 又 は 一 者 応 募 で あ る 場 合 は そ の 旨( ３ ) 当 機 構 に 提 供 し て い た だ く 情 報① 契 約 締 結 日 時 点 で 在 職 し て い る 当 機 構 Ｏ Ｂ に 係 る 情 報 ( 人 数 、 現 在 の 職 名 及 び 当 機構 に お け る 最 終 職 名 等 )② 直 近 の 事 業 年 度 に お け る 総 売 上 高 又 は 事 業 収 入 及 び 当 機 構 と の 間 の 取 引 高( ４ ) 公 表 日契 約 締 結 日 の 翌 日 か ら 起 算 し て 原 則 と し て ７ ２ 日 以 内 ( ４ 月 に 締 結 し た 契 約 に つ い て は- 3 -原 則 と し て ９ ３ 日 以 内 )( ５ ) そ の 他当 機 構 ホ ー ム ペ ー ジ ( 契 約 に 関 す る 情 報 ) に 「 国 立 研 究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構 が行 う 契 約 に 係 る 情 報 の 公 表 に つ い て 」 が 掲 載 さ れ て い る の で ご 確 認 い た だ く と と も に 、 所要 の 情 報 の 当 機 構 へ の 提 供 及 び 情 報 の 公 表 に 同 意 の 上 で 、 応 札 若 し く は 応 募 又 は 契 約 の 締結 を 行 っ て い た だ く よ う ご 理 解 と ご 協 力 を お 願 い い た し ま す 。

な お 、 応 札 若 し く は 応 募 又 は 契 約 の 締 結 を も っ て 同 意 さ れ た も の と み な さ せ て い た だ きま す の で 、 ご 了 知 願 い ま す 。

８ ． 公 的 研 究 費 の 不 正 防 止 に か か る 「 誓 約 書 」 の 提 出 に つ い て当 機 構 で は 、 国 よ り 示 さ れ た 「 研 究 機 関 に お け る 公 的 研 究 費 の 管 理 ・ 監 査 の ガ イ ド ラ イ ン( 実 施 基 準 ) 」 ( 平 成 １ ９ 年 ２ 月 １ ５ 日 文 部 科 学 大 臣 決 定 ) に 沿 っ て 、 公 的 研 究 費 の 契 約 等 にお け る 不 正 防 止 の 取 り 組 み を 行 っ て お り 、 取 り 組 み の ひ と つ と し て 、 取 引 先 の 皆 様 に 「 国 立 研究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構 と の 契 約 等 に あ た っ て の 注 意 事 項 」 ( U R L ： h t t p : / / w w w . f r a . af f r c . g o . j p / k e i y a k u / p l e d g e _ r e q u e s t / n o t e _ c o n t r a c t . p d f ) を ご 理 解 い た だ き 、 一 定 金 額 以 上の 契 約 に 際 し て 、 当 該 注 意 事 項 を 遵 守 す る 旨 の 「 誓 約 書 」 の 提 出 を お 願 い し て い ま す 。

公 的 研 究 費 の 不 正 防 止 関 係 書 類 ( ① 公 的 研 究 費 の 不 正 防 止 に か か る 「 誓 約 書 」 の 提 出 に つ いて 、 ② 国 立 研 究 開 発 法 人 水 産 研 究 ・ 教 育 機 構 と の 契 約 等 に あ た っ て の 注 意 事 項 、 ③ 誓 約 書 ) は 、入 札 説 明 書 に 添 付 し ま す の で 、 契 約 相 手 方 と な っ た 場 合 は 、 誓 約 書 の 提 出 を お 願 い し ま す 。

な お 、 当 機 構 の 本 部 、 研 究 所 、 開 発 調 査 セ ン タ ー 、 水 産 大 学 校 い ず れ か １ 箇 所 に １ 回 提 出 して い た だ け れ ば 、 当 機 構 内 の 次 回 以 降 の 契 約 で は 再 提 出 す る 必 要 は あ り ま せ ん 。

業務仕様書１．件 名 (単価契約)東シナ海及び日本海における浮魚類の環境DNA分析業務２．業務目的 本業務は水産資源研究所が引き渡す海水試料について環境 DNA 分析(網羅的解析)を行い、東シナ海および日本海における浮魚類の分布に関する基礎的知見を蓄積するものである。３．納入場所 長崎県長崎市多以良町1551-8国立研究開発法人水産研究・教育機構 水産資源研究所 長崎庁舎４．業務期限 令和6年２月２２日５．予定検体数 250検体(検体数は調査時の状況により増減する可能性がある)検体送付時期：１１月頃までにすべての検体を送付６．業務内容①本件は調査船調査で取得した海水試料について、環境DNAの網羅的解析を実施するものである。②水産資源研究所が引き渡すureaバッファー抽出液に対して分析を行う。ureaバファー抽出液は1.5mlチューブに1ml を分注して冷蔵保存した状態で引き渡す。③以降の分析は以下により構成され、一連の作業はMiya et al.,2015を参照し実施するものとする(https://doi.org/10.1098/rsos.150088)。なお、本件で使用するプライマーはMifish-Uのみでよい。④ureaバッファー抽出液について、Proteinase Kを20μL添加し、56℃で1時間静置させる。その後遠心分離を行い、上精を分取する。各チューブにBuffer AL を200μL添加し、70度10分で加熱し、100% エタノールを200μL添加する。スピンカラムを用いてDNAを抽出・精製し、MiFish プライマーを用いてライブラリーを作成する。詳細は別添に示したDNA抽出・精製手順に従うこと。⑤本件のシークエンスを行う際に可能な限り占有ランでの分析とするが、難しい場合は共有ランで分析し、インデックス・ホッピングを避けるためにMiFishアダプターで増やした他試料との共有は避ける。⑥シーケンス前にクオリティチェックを行う。ただし次世代シーケンサー(Illumina社Miseq)によるシーケンスは全検体で行い、DNA 増幅が目視で確認出来ない検体についても分析して参考資料とする。⑦分析時には必ずコントロールとしてPhiXライブラリーを適量添加する。増幅した試料は、リード数が均等になるように PCR後DNA濃度を測定し、DNAを等量混合する。⑧遺伝子配列を次世代シーケンサーを用いて 2×250 bp ランにて決定し、塩基配列データを各サンプルの Forward，Reverse ごとにまとめて fastq または tsv 形式で出力する(圧縮ファイル可)。なお、リード数は1検体あたり最低1万リードを基準とする。⑨シーケンス解析で得られた各Operational Taxonomic Unit(OTU)の代表配列を、配列相同性検索プログラム(BLAST)を用いてMiFish用リファレンスの配列と比較する。相同性が高い上位10種を一致率が高い生物種リストとしてまとめる。７．納入成果物塩基配列データ・代表配列データ・代表塩基配列のリード数と一致率解析結果・一致率が高い生物種リスト成果物は環境省が作成した「環境 DNA 分析技術を用いた淡水魚類調査手法の手引き(http://www.biodic.go.jp/edna/reports/fwfish_tebiki1.pdf)」19pを参照して作成すること。塩基配列データは fastqまたは tsv 形式、その他の成果物はcsv形式で作成しDVD等の電子記録媒体に保存した、成果物一式を格納した電子ファイルとする。８．そ の 他１)詳細については担当職員の指示に従うこと。特に作業中に疑義が生じた場合は、必ず担当職員と打ち合わせを行い、合意を得たうえで作業を進めること。２)本業務で知り得た情報について取扱責任者を置き、社内で適切に管理を行うこと。３)業務で知り得た情報について、第三者への開示をしないこと。４)成果物の提出の際は必ずファイルのウィルスチェックを行うこと。５)引き渡しにかかる送料等は当機構負担とし、納入にかかる送料等については、請負業者負担とする。別添資料：DNA抽出・精製手順【試薬・機器】DNeasy Blood and Tissue kit (Qiagen社製)【DNA抽出】① 1mL Urea抽出Bufferに対してProteinase K(Qiagen)を20µLずつ添加し、恒温槽で56℃で1h静置② 6000xgで1min遠心分離③ 各チューブにAL Bufferを200µLずつ添加④ 各チューブにエタノールを200µLずつ添加し、70℃で10分加温⑤ DNA抽出キットのカラムに⑥を600µLずつ添加する⑥ 6000xgで1min遠心分離⑦ カラムに残試料を添加⑧ 6000xgで1min遠心分離⑨ カラムにBuffer AW1を500µL添加⑩ 6000xgで1min遠心分離⑪ カラムにBuffer AW2を500µLずつ添加⑫ 20400xgで2min遠心分離⑬ チューブごとろ液を廃棄し、新しいチューブにカラムを移す⑭ カラムを新しいチューブに乗せ換える⑮ カラムにBuffer AEを110µLずつ添加し、常温で1min静置⑯ 6000xgで1min遠心分離⑰ 溶出液は-25℃で冷凍保存する