入札情報は以下の通りです。

件名遺伝子解析に基づいた魚類の網羅的及び定量的把握補助業務
公示日または更新日2024 年 5 月 23 日
組織国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所
取得日2024 年 5 月 23 日 19:25:06

公告内容

まで提出様式は別添様式1を使用することとし、提出方法は、電子入札システムでの提出、又は上記3.(1)への直接持参か郵送による。

提出期限は令和6年6月6日16時00分までとする。

(3) 入札参加意思の表明期限、場所及び方法この入札に参加を希望する者は、2.に掲げる競争参加資格を証明する書類を提出し、入札参加意思の表明を行わなければならない。

契約条項を示す場所、入札心得、仕様書を交付する場所は、上記3.(1)の担当部署のほか、国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所 港湾空港技術研究所ホームページ(https://www.pari.go.jp)により交付する。

国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所 管理調整・防災部 管理課 契約係TEL 046-844-5039 ,FAX 046-841-8307(2) 契約条項を示す場所、入札心得、仕様書を交付する場所及び方法(1) 担当部署〒239-0826 神奈川県横須賀市長瀬三丁目1番1号(7) 電子入札システムにより参加される場合は、ICカードを取得し、電子入札システムにて利用者登録を行う。登録を行う際には、事前に当研究所の定めた業者番号の通知を受けること。

電子入札登録については、当研究所のホームページで公表している。

https://www.mpat.go.jp/ebid/index_ebid.html3.入札手続等(6) 令和5・6年度国土交通省の競争参加資格の「建設コンサルタント等」の資格を有している者であること。

手続開始の申立てがなされている者でないこと。

(5) 警察当局から、暴力団員が実質的に経営を支配する者又はこれに準ずるものとして、国土交通省公共事業等からの排除要請があり、当該状態が継続している者でないこと。

(2) 港湾空港技術研究所長から入札参加資格停止の措置を受けていない者であること。

(3) 国土交通省国土技術政策総合研究所副所長から指名停止の措置を受けていない者であること。

(4) 会社更生法に基づき更生手続開始の申立てがなされている者又は民事再生法に基づき再生2.競争参加資格等(1) 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所契約事務取扱細則第31条の規定に該当しない者であること。

(4)履行期限契約締結日~令和7年3月3日国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所 港湾空港技術研究所(3) 業 務 内 容 別冊、仕様書のとおり(1) 業務の名称 遺伝子解析に基づいた魚類の網羅的及び定量的把握補助業務(2) 履 行 場 所 神奈川県横須賀市長瀬3丁目1番1号令和6年5月23日 契約担当役 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所港湾空港技術研究所長 河合 弘泰(公印省略)1.概要入札 第39号入 札 公 告次のとおり一般競争入札に付す。本業務は電子入札システム対象案件である。

到着分までまで。

する場合には、当該法人への再就職の状況、当該法人との間の取引等の状況について情報を公開するなどの取組を進めるとされている。これに基づき、以下のとおり、当所との関係に係る情報を当所のホームページで公表するので、所要の情報の当所への提供及び情報(9) 独立行政法人が行う契約に係る情報の公表独立行政法人が行う契約については、「独立行政法人の事務・事業の見直しの基本方針」(平成22年12月7日閣議決定)において、独立行政法人と一定の関係を有する法人と契約を当該金額に1円未満の端数があるときは、その端数金額を切り捨てた金額)をもって落札価格とするので、入札者は消費税に係る課税事業者であるか免税事業者であるかを問わず、見積もった契約希望金額の110分の100に相当する金額を入札書に記載すること。

予定価格の制限の範囲内で最低価格をもって有効な入札を行った者とする。落札決定に当たっては、入札書に記載された金額に当該金額の100分の10に相当する額を加算した金額(当所のホームページで公表する。

(8) 落札者の決定方法(6) 入札参加の意思表明を行わない者の入札は認めない。

(7) 開札結果の通知 開札の結果については、応札者に対し、速やかに通知する。また、速やかにおいて2.に掲げる競争参加資格のない者の行った入札は無効とする。

(5) 契約書作成の要否 要。

していた場合には落札決定を取り消す。

なお、競争参加資格のあることが確認された者であっても、開札時に(4) 入札の無効 本公告に示した競争参加資格のない者のした入札及び入札に関する条件に違反した者の入札は無効とするとともに、無効の入札を落札者と(3) 契約保証金 免除。

4.その他(1) 手続きにおいて使用する言語及び通貨 日本語及び日本国通貨に限る。

(2) 入札保証金 免除。

開札場所: 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所 港湾空港技術研究所その他 : 開札の結果、予定価格の制限の範囲内に達する有効な入札がないときは、再度入札を行う。

なお、再度入札は1回のみとする。

この場合、電子入札参加者は、再度入札時においても電子入札システムにて提出すること。

紙入札参加者は、電送(ファクシミリ)による入札を原則とし、原本を後日提出すること。

(6) 開札の日時及び場所等開札日時:令和6年6月13日10時00分提出方法: 電子入札システムでの提出、又は上記3.(1)への直接持参か配達証明付書留等による郵送。

受付場所: 〒239-0826 神奈川県横須賀市長瀬三丁目1番1号国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所 管理調整・防災部 管理課 契約係受付期間:令和6年6月10日から令和6年6月12日電子入札システムによる提出の場合は 15時00分 令和6年6月12日(5) 入札の受付期間及び受付場所並びに入札書の提出方法回答期限は令和6年6月7日17時00分までとする。

質問に対する回答書は、国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所 港湾空港技術研究所 ホームページ(https://www.pari.go.jp)において閲覧に供するほか、電子入札システムにて行う。

よる。なお、電子入札システムにより提出した場合は、提出先へその旨電話連絡すること。

提出期限は令和6年6月6日16時00分までとする。

(4) 入札手続等(入札心得、仕様書等を含む。)に対する質問及び回答書この入札手続等に対する質問がある場合においては、書面(様式は自由)により提出すること。なお、提出方法は、電子入札システムでの提出、又は上記3.(1)への直接持参か郵送に入札参加意思の表明を行った者が2.に示す競争参加資格を満たしていないと判断された場合、入札の参加をお断りする旨 令 和 6 年 6 月 7 日までに通知するものとする。

なお、電子入札システムにて提出の場合は、競争参加資格を有する場合でも通知する。

① 契約締結日時点で在職している当所OBに係る情報(人数、現在の職名及び当所にお ける最終職名等) ② 直近の事業年度における総売上高又は事業収入及び当所との間の取引高4)公表日 ・3分の1以上2分の1未満、2分の1以上3分の2未満又は3分の2以上 ④ 一者応札又は一者応募である場合はその旨3)当所に提供する情報 ② 当所との間の取引高 ③ 総売上高又は事業収入に占める当所との間の取引高の割合が、次の区分のいずれか に該当する旨以上 契約締結日の翌日から起算して原則として72日以内(10) 手続きにおける交渉の有無 無(11) その他 詳細は入札心得による。

契約先の名称、契約金額等と併せ、次に掲げる情報を公表する。

① 当所の役員経験者及び課長相当職以上経験者(当所OB)の人数、職名及び当所におけ る最終職名 ② 当所との間の取引高が、総売上高又は事業収入の3分の1以上を占めていること2)公表する情報 上記に該当する契約先について、契約ごとに、物品役務等の名称及び数量、契約締結日、 ① 当所において役員を経験した者(役員経験者)が再就職していること又は課長相当職 以上の職を経験した者(課長相当職以上経験者)が役員、顧問等として再就職してい ることの公表に同意の上で、応札すること。なお、応札をもって同意されたものとする。

1)公表の対象となる契約先 次のいずれにも該当する契約先(様式1): : : :電話番号契約担当役 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所 港湾空港技術研究所長 殿住所商号又は名称件 名 : 遺伝子解析に基づいた魚類の網羅的及び定量的把握補助業務添付資料 入札公告2.(6)を証する資料 るにあたり、競争参加資格について確認されたく、申請致します。

なお、入札公告2.(1)から(5)に掲げる事項については該当しない者である ことを誓約致します。

記FAX 番 号e-mail令和6年5月23日付けで入札公告のありました下記案件に係る競争に参加を希望す代表者氏名 印法人番号担当者氏名 印入札 第39号競争参加資格確認申請書令和 年 月 日

令和6年度遺伝子解析に基づいた魚類の網羅的及び定量的把握補助業務仕 様 書令和6年5月国立研究開発法人 海上・港湾・航空技術研究所11.業務概要本業務は、東京湾において採取された海水を分析して魚類の遺伝子情報を取得し、魚類の網羅的及び定量的な把握の補助を行うものである。2.履行期間契約締結日より令和7年3月3日までとする。なお、履行期間中の土曜日、日曜日、休日、夏期休暇及び年末年始休暇は、休日として設定している。3.業務仕様3-1.DNA抽出受注者は、調査職員から冷凍で送付される GF/F ろ過フィルターから DNA 抽出を実施する。DNA抽出を実施する資料は、計75資料(資料あたり約2L,サンプル60資料,ブランク15資料)である。サンプルの採取時期については、調査職員から事前に連絡する。3-2.種特異的解析(1) 受注者は、3-1で抽出したサンプル全てについて、種特異的解析及びそのコピー数の算出(PCRは4回繰り返し)を実施するものとする。(2) 種特異的解析及びそのコピー数の算出は、リアルタイムPCRを用いて実施する。サンプルの採取時期については、調査職員から事前に連絡する。(3) 受注者は、定量分析を行うにあたって、人工合成遺伝子を用いた品質管理を行う。なお、人工合成遺伝子による品質管理では、4段階の濃度レベルの検量線を引くことを想定している。(4) 受注者は、抽出した DNA について、再分析の可能性を考慮して1か月程度保管する。破棄にあたっては、事前に調査職員の確認を得る。(5) 種特異的解析は、コイ(Cyprinus carpio)に限定して実施する。3-3.魚類の網羅的な定量解析(1) 受注者は、魚類の網羅的解析を目的としたメタバーコーディング解析(1st PCRは8回繰り返し)を実施するものとする。(2) 受注者は、3-1で抽出したサンプル全てについて、次世代シーケンサーを用いて網羅的解析を目的としたメタバーコーディング解析を行う。魚類の分析においては、それぞれ、MiFishプライマーセット(MiFish-U,MiFish-Ev2,MiFish-U2)を用いる。海水サンプルの採取時期については、調査職員から事前に連絡する。(3) 受注者は、魚類の網羅的な検出において、MiFish のデータベース(http://mitofish.aori.u-tokyo.ac.jp/mifish)、NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)などで照合し、可能な限り種を特定する。(4) 受注者は、対象サンプル内にふくまれるDNAと区別できるように工夫された定量に使用する検量線作成用のDNA(以下、内部標準DNA)を用意する。内部標準DNAに用いる魚種は3種程度とし、それぞれの濃度は異なること。なお、受注者は、内部標準DNAによって作成する検量線が、リード数からコピー数を算出するために適切に使用できることを少なくとも1度確認した上で資料を分析する。(5) サンプルのデータ解析はUshio et al.(2018)※に従って行うこと。※Ushio, M. et al. Quantitative monitoring of multispecies fish environmental DNAusing high-throughput sequencing. Metabarcoding and Metagenomics 2, (2018).

24.成果物4-1.成果物本業務における業務完成図書は、電子納品によるものとする。(1) 電子納品とは、解析データ等すべての最終成果(以下「業務完成図書」という)を電子データで作成し、納品するものである。(2) 「業務完成図書」は、作成した電子データを電子媒体(CD-R又はDVD-R)で2部提出するものとする。なお、「業務完成図書」の詳細内容及び電子化については、調査職員と協議のうえ、決定するものとする。4-2.提出先神奈川県横須賀市長瀬 3 丁目 1 番 1 号国立研究開発法人 海上・港湾・航空技術研究所 港湾空港技術研究所5.検 査本仕様書のとおり実施されたことの確認をもって検査とする。6.その他(1) 本仕様書に明記なき事項及び本業務の遂行上疑義が生じた場合は、両者が協議のうえ、決定するものとする。また、業務内容の変更により、契約金額に変更が生じる場合は、両者が協議のうえ、履行期間末日までに、契約変更を行うものとする。(2) 本業務により得られた成果は、当所に帰属するものとする。(3) 本業務の遂行上過程では、調査職員と綿密な連携を保ち、進捗状況を報告するものとする。(4) 本業務により得られた情報および成果は、当所の許可なく公表したり、他に転用してはならない。以 上3別 紙DNA抽出(GF/Fフィルター)採取場所 採取時期 数量東京湾 2024年6月頃 15東京湾 2024年8月頃 15東京湾 2024年10月頃 15東京湾 2024年11月頃 15東京湾 2025年1月頃 15種特異的解析採取場所 採取時期 数量東京湾 2024年6月頃 15東京湾 2024年8月頃 15東京湾 2024年10月頃 15東京湾 2024年11月頃 15東京湾 2025年1月頃 15魚類の網羅的な定量解析採取場所 採取時期 数量東京湾 2024年6月頃 15東京湾 2024年8月頃 15東京湾 2024年10月頃 15東京湾 2024年11月頃 15東京湾 2025年1月頃 15